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Programme des cours 2013-2014Dernière mise à jour : 19/04/2014
STAT1221-2  Méthodes statistiques et bioinformatique

Durée :  24h Th, 12h SEM
Nombre de crédits :  
Master en statistiques, orientation biostatistique, à finalité spécialisée, 2e année3
Nom du professeur :  Laurence Lins
Langue(s) du cours :  
Langue française
Organisation et évaluation :  
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Contenus du cours :  
-analyse de la composition en acides aminés des protéines - analyse d'hydrophobicité - banques de séquences - recherche d'homologies - alignement de séquences - recherche de motifs fonctionnels - prédiction de structures secondaires - prédiction de structure tridimensionnelle
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :  
Montrer à l'étudiant les méthodes utilisées en bioinformatique (analyse de séquences et analyse de structure) A l'issue du cours, l'étudiant doit être capable de sélectionner la ou les méthodes bioinformatiques adéquates en fonction de l'information demandée
Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :  
Connaissances chimiques de base sur les protéines sont absolument requises: cf nom, structure et propriétés chimiques des acides aminés structures primaires et secondaires des protéines (notion d'angle phi/psi, hélice alpha, structures béta, coils ...)
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :  
quatre séances d'apprentissage de manipulation des méthodes en libre accès sur internet seront dispensés
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :  
Cours magistral : 24h learning sessions: 12 h
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :  
  • La bioinformatique pour les nuls
  • Bioinformatics basics: Applications in biological science and medicine, L. Buehler and H. Rashidi, 2d edition, Taylor and Francis, CRC Press, 2005
Modalités d'évaluation et critères :  
Travail personnel (100%)
Stage(s) :  
Remarques organisationnelles :  
Contacts :  
Lins, Laurence (Maître de recherche FNRS) Centre de Biophysique Moléculaire Numérique 081 62 25 21 l.lins@ulg.ac.be


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